Con fecha 19 de Marzo de 2010, se publicó en el Diario Oficial, la primera Norma Secundaria de Calidad Ambiental, la cual protege las aguas continentales de la cuenca del río Serrano, en la Región de Magallanes y Antártica Chilena. Después de un largo proceso normativo, que comenzó en diciembre de 2005, finalmente se cuenta con un instrumento básico de gestión ambiental capaz de constituirse en normativa para el desarrollo sustentable de la cuenca hidrográfica, al establecer las condiciones en que el agua puede considerarse libre de contaminación. De esta manera, se busca prevenir el deterioro ambiental, proteger y conservar la biodiversidad acuática y la calidad básica de las aguas continentales superficiales de la cuenca hidrográfica del río Serrano.

La cuenca hidrográfica del Río Serrano posee una extensión de 6.673 km2 que incluye una serie de grandes y pequeños lagos concadenados, sin o con muy escasa intervención humana. Este cauce abarca una porción importante de la superficie del Parque Nacional Torres del Paine y parte del Parque Nacional Bernardo O´Higgins. Las condiciones naturales del área, han sido propicias para el desarrollo de especies de flora y fauna que se encuentran en alguna categoría de conservación, como por ejemplo el huemul, ñandú, puma, puye, peladilla y especies de flora tales como el ciprés de las guaitecas y la mata negra.

Las áreas de vigilancia fueron definidas según la presencia de estaciones de la Dirección General de Aguas (DGA), organismo que mantienen un monitoreo periódico de la calidad de las aguas de los ríos o tramos a normar. Siguiendo criterios distintos, se definieron 8 ríos separados en 9 estaciones de vigilancia: 1) río Serrano, 2) río Paine, 3) río Grey, 4) río Baguales, 5) río Vizcachas, 6) río de Las Chinas, 7) río Tres Pasos y 8) río Don Guillermo. Los valores determinados, fueron definidos de acuerdo a la calidad actual de los cursos de agua seleccionados, considerando la excelente calidad de las aguas de la cuenca.

Actualmente se esta trabajando en la elaboración del Programa de Vigilancia Ambiental (PVA) el cual es el instrumento que coordinará a las instituciones competentes, para llevar a cabo la verificación del cumplimiento de dicha norma y el levantamiento de información adicional que sea indispensable para un mayor conocimiento de la calidad de las aguas de la cuenca, con el fin de aplicarlo a las futuras revisiones de la misma. Éste esta siendo diseñado en forma integral por la Dirección Regional de CONAMA, Dirección General de Aguas (DGA) y por el Servicio Agrícola y Ganadero (SAG).